トポロジカルデータ解析(TDA)のライブラリ

トポロジカルデータ解析(Topological Data Analysis:TDA)とは、トポロジーの視点からデータの特徴を捉えて分類や定量化を行う数学的な解析手法です。

 

ここではTDAのライブラリを2つ紹介したいと思います。

Mapper

Mapperとは点群データからグラフを構成する手法です。

 

pip install kmapper

の後に

pip install python-igraph plotly ipywidgets

でインストールできます。

 

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Ripser


点群のVietoris-Ripsフィルトレーションのパーシステントホモロジーを高速に計算するソフトウェアです。

 

必要に応じてnumpyを最新バージョンにアップグレードします。

pip install --upgrade numpy

 


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